Недалеко от Анапы смертным огнем полыхала Малая Земля. В ночь на 1 мая 1943 года в районе села Варваровка со сторожевого катера на берег был высажен морской десант с целью отвлечения немецких сил от Малой Земли. Однако две группы десантников из трех были вскоре обнаружены врагами и окружены. В этом бою последним погиб командир капитан Д. С. Калинин. Оставшись последним в живых, весь иссеченный пулями и осколками, он подорвал себя и подбежавших фашистов противотанковой гранатой. Капитану было посмертно присвоено звание Героя Советского Союза, а на месте гибели моряков воздвигнут мемориал.
С разгромом фашистских войск под Новороссийском 23 сентября 1943 года Анапа была полностью очищена от фашистов. За короткий срок временной оккупации нанесен огромный ущерб. Из всего довоенного жилого фонда уцелело только 4%, государственные здания взорваны. Главный врач первого восстановленного санатория Г. К. Агзибеков писал: "Курорт был разрушен до основания, и на месте прекрасных зданий санаториев остались одни руины. Приморский парк был вырублен, Песчаный пляж заминирован, все постройки на нем уничтожены".